Das 12 jährige Mädchen Ofelia (Ivana Baquero) reist mit ihrer Mutter (Adriana Gil) zu ihrem Stiefvater (Sergi Lopez), der Hauptmann einer militärischen Truppe ist. Die Reise ist gefährlich, denn der Hauptmann jagt Partisanen in den nordspachnischen Gebirgen. Capitan Vidal (Name des Hauptmanns) besteht allerdings auf die Nähe seiner neuen Frau, denn sie trägt das ungeborene Kind von ihm in sich. Auf dem Weg, hät der Wagen kurz an, denn Ofelia geht es nicht gut und übergibt sich am Waldrand. Dort entdeckt sie eine Statue, die ein Auge fehlt. Ein naheliegender Stein fügt sie der Statue als Auge ein. Daraufhin begleitet sie ein Insekt unbemerkt. Die Reise fährt fort und bei der Ankunft entdeckt das Mädchen ein Mauerwerk mit einem Tor. Ein Angestellter des Hauptsmanns erzählt, dass dies der Eingang eines Labyrinth sei.
Das Insekt entpuppt sich vor Ofelia als Fee und zeigt ihr den Eingang zum Labyrinth. Pan (Doug Jones) ist der Wächter des Labyrinths und sieht das Mädchen als die verlorene Prinzessin. Der Wächter erlegt Ofelia drei Prüfungen, die sie erfolgreich bestehen muss, damit sie wieder in das Königreich eintreten darf. "Daheim" hat die Mutter Probleme mit der Schwangerschaft und so kämpft sich Ofelia durch die Prüfungen und hilft nebenbei ihre Mutter so gut wie sie kann.
